Diferencias clave entre VERIFACTU y el SII: guía para empresas, pymes y autónomos

La digitalización fiscal en España avanza hacia un control más exhaustivo y automatizado de la facturación. En este contexto, resulta esencial que empresas, pymes y autónomos comprendan las diferencias entre los sistemas VERIFACTU y SII, dos modelos con objetivos y obligaciones distintas pero complementarias en la estrategia de la Agencia Tributaria.

Tras la reciente publicación de nuestro artículo sobre el nuevo sistema VERIFACTU, en esta entrada profundizamos en los aspectos técnicos y operativos que distinguen ambos modelos, para ayudarle a planificar una correcta adaptación antes de que las nuevas obligaciones entren en vigor.

1) Qué es cada sistema

1.1 SII (Suministro Inmediato de Información)

El SII es un sistema de llevanza electrónica de los libros registro de IVA a través de la Sede electrónica de la AEAT, mediante el suministro casi inmediato de los registros de facturación (en general, dentro de 4 días hábiles). Está pensado para determinados contribuyentes con período de liquidación mensual (REDEME, Grandes Empresas y Grupos de IVA). 

1.2 VERIFACTU (Sistemas Informáticos de Facturación, R.D. 1007/2023)

VERIFACTU es el marco que regula los Sistemas Informáticos de Facturación (SIF) para garantizar integridad, trazabilidad e inviolabilidad de las facturas y de sus registros. Permite, además, remitir los registros de facturación a la AEAT (modalidad VERIFACTU) y consultar dichos registros. 

2) Ámbito de aplicación y obligados

• SII: obligatorio para quienes tienen periodicidad mensual del IVA —REDEME, Grandes Empresas (>6.010.121,04 €) y Grupos de IVA—, con posibilidad de adhesión voluntaria para otros sujetos. 
• VERIFACTU: alcanza a empresarios y profesionales que usan software de facturación, con requisitos técnicos comunes (encadenado, huellas, QR, registros auditables) y opción de envío a AEAT en modo VERIFACTU. 
  
  

3) Finalidad y enfoque del control

• SII: control del IVA mediante suministro casi inmediato de libros registro (emisión y recepción), con efectos colaterales (eliminación de modelos 347 y 390 para quienes están en SII). 
•  VERIFACTU: foco en la calidad del dato de facturación (integridad, trazabilidad, inalterabilidad) y en la posibilidad de suministro a AEAT de los registros creados por el SIF.
  
  

4) Diferencias operativas: plazos, datos y transmisión

Aunque ambos sistemas persiguen reforzar el control fiscal y la transparencia en la facturación, su funcionamiento operativo es distinto en varios aspectos clave:

• Objeto principal:
  El SII tiene como finalidad principal la remisión electrónica de los libros registro de IVA a la Agencia Tributaria, de forma casi inmediata a la emisión o recepción de las facturas.
  Por el contrario, VERIFACTU se centra en garantizar la integridad y trazabilidad de cada factura emitida, asegurando que no pueda ser alterada ni borrada, y que cada registro quede debidamente encadenado y firmado.
  
  
• Plazos de envío:
  En el SII, los datos deben remitirse en un plazo máximo de cuatro días hábiles desde la emisión o recepción de la factura (o hasta ocho días en casos especiales).
  En VERIFACTU no existe un plazo de envío idéntico: el registro debe generarse en el mismo momento de emisión, quedando almacenado en el sistema informático de facturación. Si el contribuyente opta por la modalidad “VERIFACTU”, el envío a la AEAT puede realizarse de manera automática o periódica, pero no bajo un plazo reglado como en el SII.
  
  
• Sujetos obligados:
  El SII es de aplicación a Grandes Empresas, Grupos de IVA y entidades inscritas en el REDEME, aunque también puede adoptarse voluntariamente. VERIFACTU, en cambio, afectará a empresas, pymes y autónomos que emitan facturas mediante software, lo que amplía de forma significativa el número de contribuyentes implicados en este nuevo modelo.
  
  
• Tipo de información transmitida:
  Mientras el SII transmite los datos de los libros registro de IVA —facturas emitidas y recibidas, bienes de inversión y determinadas operaciones intracomunitarias—, el sistema VERIFACTU se centra en las facturas emitidas, cada una identificada con un código único, un “hash” encadenado y un código QR que permite su verificación y trazabilidad.
  
  
• Compatibilidad entre sistemas:
  Ambos modelos son excluyentes: quienes estén obligados al SII no deberán aplicar VERIFACTU en su modalidad de envío, ya que sus obligaciones quedan cubiertas por el propio SII. Sin embargo, sí se recomienda que los programas de facturación de estos sujetos cumplan los requisitos de integridad técnica de VERIFACTU, de cara a futuras adaptaciones y para garantizar un mayor control interno.
  
  

5. Recomendaciones según perfil de empresa 

• Si la empresa está obligada al SII, deberá concentrar el cumplimiento en dicho sistema. No obstante, conviene que el software de facturación cumpla los requisitos de integridad exigidos en VERIFACTU. 
• Si no está sujeta al SII, debe preparar su sistema de facturación conforme al Reglamento VERIFACTU antes de la fecha límite. Es aconsejable anticiparse para evitar sanciones o requerimientos.
• La adopción voluntaria del modo VERIFACTU puede aportar transparencia y reducir el riesgo de inspecciones.

En definitiva, VERIFACTU y SII responden a objetivos distintos dentro de la estrategia de digitalización fiscal. Mientras el SII centraliza el control del IVA, VERIFACTU garantiza la fiabilidad e integridad de la facturación. Desde Casas & Asociados recomendamos evaluar el sistema más adecuado para cada empresa, planificar la adaptación con tiempo y verificar la conformidad técnica del software de facturación.